Происхождение SARS-CoV-2

Mar 25, 2023 12:53


Этот пост «библиографический», он привязан к соответствующей строке «Каталога блога» (см. верхний пост). В списке ниже посты, имеющие отношение к проблеме происхождения SARS-CoV-2. Их немного, т.к. на эту тему я высказывался в основном в комментариях. Если коротко я:

1) полностью исключаю генно-инженерное «изготовление» SARS-CoV-2

2) гипотезу о « ( Read more... )

covid-19, происхождение коронавируса, sars-cov-2

Leave a comment

imfromjasenevo March 25 2023, 17:12:41 UTC

а как это можно вообще подобное доказать без обысков в лабораториях?

можно увидеть, что РНК вируса состоит из столь разнородных кусков, что не могла появиться в результате ественных мутаций?

можно ли доказать, что вспышка была сильно раньше, (например, на полгода), а власти пытались замести дело под ковер?
Возможны ли иски к Китаю в этом случае?

Reply

prof_afv March 25 2023, 17:44:12 UTC

а как это можно вообще подобное доказать без обысков в лабораториях?

Никак. И "обыски", даже если бы они были возможны, ничего бы не обнаружили

можно увидеть, что РНК вируса состоит из столь разнородных кусков, что не могла появиться в результате естественных мутаций?

В геноме SARS-CoV-2 нет ничего, что не могло бы появиться в результате естественной эволюции (рекомбинации и мутации + отбор)

можно ли доказать, что вспышка была сильно раньше, (например, на полгода), а власти пытались замести дело под ковер?

Твердо установлено, что первые случаи (госпитализации) появились в середине декабря 2019. Первая идентификации вируса (метагеномным анализом, в частном порядке) была сделана 26-27 декабря 2019. К этому времени на 15 миллионных Ухань около 20 больных (в разных госпиталях) и не было летальных случаев. 31 декабря 2019 (могу ошибаться в датах +/- 1-2 дня) в Ухань прибыла команда из китайского CDC. 1 января 2020 Китай официально известил ВОЗ о вспышке. В районе 6-7 января китайцы передали в ВОЗ и выложили в открытый доступ полную ( ... )

Reply

kompleksnaya_l March 26 2023, 00:07:08 UTC

Это очень необычные пневмонии, особенно в самом начале, при первом диком вирусе.

И судя по тому что приходило в Нью Йорке, мало сомнений что в густонаселённом Ухане не было сильно по другому - внезапно появлялось очень большое количество больных пневмонией, очень странной, стремительно ухудшавшихся, при невосприимчивости к попыткам их лечения.

Reply

prof_afv March 26 2023, 00:58:58 UTC

Никакого большого числа случаев в госпиталях Уханя во второй половине декабря 2019 не было. На 26-12-19 было 4 случая, на 28-12-2019 было 7 случаев. Это всего, в разных госпиталях, в 14-миллионном городе! К 26-27-12-2019 было проведено первое секвенирование (в частной компании Vision Medical), неофициальное, организованное кем-то из одного из госпиталей (кажется главврачом). На следующий день ему сообщили устно (по телефону), что в образце обнаружены последовательности нового вируса. Приблизительно в эти же дни обнаружили общий радиологический признак - «матовое стекло». На 31-12-2019 было 27 случаев и была установлена эпид связь с рынком Huanan. В это время центральные эпид службы уже были в Ухане. 1-1-2020 рынок был закрыт и о вспышке уведомлена ВОЗ.

Где ещё в таких обстоятельствах могли бы сработать быстрее?

Reply


areksi March 25 2023, 17:36:31 UTC

Довольно интересно, Вы может быть можете составить линки по обсуждению этих умозаключений? Мне было бы интересно понять логику российских вирусологов, поскольку в моей среде (вирусологов разного происхождения) никто, из читавших статьи всей этой компании года с 2012 если не раньше, не сомневается в искусственном происхождении и побеге...

Reply

areksi March 25 2023, 17:48:31 UTC

технология seamless cloning доступна всем, так что бессмысленно искать какие-то "следы". Цели исследований и процесс их ясно и полно изложены в многочисленных публикациях. Всего, что не достает, это документация "побега" адаптированного к человеческим клеткам штамма. А я могу сказать как, сам был не однократно свидетелем поедания иммунизированных кроликов (а в Китае может и еще кого едят) после лабораторной работы. То есть, логика у Вас вполне в стиле Раканиелло с Гриффином и его компанией, но есть проблемы?

Reply

mary_spiri March 26 2023, 02:08:16 UTC

Seamless cloning не мешает определять наличие генной инженерии. Основной признак: разница в принципах построения разных генов из одного и того же генома, например, отличия частоты использования кодонов. Эти же признаки используются для определения горизонтального переноса генов между разными группами организмов.

Так что отследить чужеродность гена для конкретного генома несложно.

Вторая линия аргументации, хорошо описанная Евгением Куниным, это наличие похожих генов у близких природных вирусов. Большинство так называемых признаков генной инженерии встречаются в природе, причем их эволюцию можно проследить.

Reply

prof_afv March 26 2023, 02:31:44 UTC

Так что отследить чужеродность гена для конкретного генома несложно.

И каков результат подобного "несложного" анализа генома SARS-CoV-2 на чужеродность тех или иных его участков? Если Вы считаете, что найдено что-то указывающее на генно-инженерные манипуляции, то что это конкретно?

Reply


areksi March 25 2023, 18:24:31 UTC

Неужели Вы думаете что я этого не читал. Даже писал, и помогал редактировать...

Reply

prof_afv March 25 2023, 18:30:09 UTC

Судя, по тому, что используете эти гранты как аргумент, либо не читали, либо не понимаете насколько отличаются геномы SARS_CoV-2 и SARS-CoV-1

Reply

areksi March 25 2023, 18:33:33 UTC

Какая связь? Тут не конкретные геномы важны, а как и зачем это делается...

Reply

prof_afv March 25 2023, 18:43:24 UTC

Важны именно конкретные геномы.

Как "пересадить" ген S от вируса летучей мыши в геном известного вируса SARS-CoV-1 достаточно очевидно.

Но как, с помощью той же технологии (по-вашему "как это делается") сделать гибрид неизвестного (до сих пор) вируса с другим тоже неизвестным вирусом в 2019г? Это вопрос на который, на мой взгляд есть только один ответ - в 2019г это было невозможно.

Может хватит? Вроде договорились. Не хотелось бы применять «административные меры»

Reply


mary_spiri March 26 2023, 15:38:13 UTC

Насчёт аттенуации - вы мне пытались рассказать, что уровне организма она не возможна: "никогда на организмах". Я вообще-то 4 года занималась профессионально вирусами человека в американском университете. Мне не надо рассказывать про аттенуацию.

Можно воссоздать то, что уже существует и хорошо описано/секвенировано. То есть взять имеющийся Ковид и синтезировать геном. Правда и тут в 6 недель уложиться сложно (говорю как человек в данным момент занимающийся синтезом генов). А научный процесс создания вируса под технические характеристики путем направленной эволюции в лабе занимает гораздо больше времени и к успеху приводит в простых случаях. С Ковидом случай сложный, там течение болезни зависит от взаимодействия с целым организмом хозяина, которое в лабе не моделируется. Грубо говоря, тут опыты на людях нужны. Не думаю, что у вас есть такая возможность.

Reply


lazy_glutton March 27 2023, 15:30:08 UTC
В новостях яндекса прошла такая информация:

Nature Microbiology: коронавирус вызывает изменения в структуре генома
В клетках людей, инфицированных SARS-CoV-2, могут происходить изменения в структуре генома, способствующие нарушению в функциях иммунной системы и долговременным симптомам.
К такому выводу пришли ученые Техасского университета в Хьюстоне, которые представили результаты научной работы в журнале Nature Microbiology.
Известно, что некоторые вирусы способны изменять хроматин - структуру, в форме которой в ядре клетки хранится генетический материал.
H3K4me3 способствует активации провоспалительных генов, вызывающих тяжелые симптомы COVID

Ссылка на статью: https://www.nature.com/articles/s41564-023-01344-8

Можете прокомментировать?

Reply

prof_afv March 27 2023, 16:30:56 UTC

Очень бегло просмотрел. Статья интересная. Для меня это стимул «обновить» знания о структурах хроматина и о том, как это исследуется (признаюсь, давно не обновлялись).

Пока могу сказать, что «эпохальности» в этом исследования не вижу. На мой взгляд (предварительный), это в большей степени демонстрация методических возможностей. Обнаруженные эффекты (скажем, «разрегуляция» работы системы интерферона) интересны и заслуживают того, что в этом «копаться» дальше.

Но (большое «но»), все сделано в очень искусственной системе in vitro - инфицирование SARS-CoV-2 высокочувствительной культуры клеток. Ситуация in vivo на порядки сложнее. Заявленная «уникальность» включаемых SARS-CoV-2 изменений хроматина базируется на сравнении только с одним вирусом. На мой взгляд «за уши притянуто, что это может иметь значение в патогенезе «длинного КОВИДа». Ведь инфицированные вирусом клетки (если больной выздоравливает) не выживают, а устраняются. Для того чтобы, обсуждать всё это в контексте пост-КОВИДы должно быть установлено, что in vivo эти нарушения ( ... )

Reply

lazy_glutton March 27 2023, 17:15:51 UTC
Спасибо!
Значит сми, как обычно, написали громкие заголовки ))

Reply


Leave a comment

Up